《中华胃肠外科杂志》是目前国内惟一的胃肠外科专业性学术期刊。1998年5月创刊，1999年正式公开发行。2000年3月被批准加入国家统计源期刊，2000年6月始改由中国科协主管，跻身于中华医学会系列杂志行列，2001年1期始更名为《中华胃肠外科杂志》。2003年3月由季刊改为双月刊。2005年2月在美国国立图书馆“文献选择技术评审委员会”的评审中获得“very good”的评价，于同年3月7日被MEDLINE数据库正式收录（目前为止，我国外科类医学期刊只有两本进入该数据库，另一本是《中华外科杂志》）。
   

    《中华胃肠外科杂志》在国内，为《中国学术期刊（光盘版）》和中国期刊网全文数据库收录期刊，是中国学术期刊综合评价数据库来源期刊；同时被收录为国家科技部“中国科技论文统计源期刊”（中国科技核心期刊）和《中国核心期刊（遴选）数据库》，还是《中国生物医学核心期刊》。
  

    《中华胃肠外科杂志》主要刊登胃肠外科和相关学科的临床研究、基础理论和实验研究的成果与进展，以从事普通外科和胃肠外科以及相关专业的临床、科研、教学的高中级医师为主要读者对象。办刊宗旨是全面系统地反映我国胃肠外科领域的学术动态和国内外最新进展，促进我国胃肠外科的学科发展和学术交流。
   

    担负着《中华胃肠外科杂志》审稿、撰稿、组稿任务的编委会由一支涵盖全国的胃肠外科专家队伍组成，他们都是全国各地医科院校附属医院和省市级以上医院从事本专业的学科优秀带头人，在国际、国内学术上十分活跃并卓有成效。杂志的主编汪建平教授，现任中华医学会理事，中华医学会外科学分会结直肠肛门外科学组组长，广东省医学会副会长，广东省胃肠外科学组组长，亚洲造口学校中国区主席，中山大学副校长，医学部主任，中山大学附属第六医院（附属胃肠肛门医院）院长。副主编秦新裕教授，现任中华医学会外科学胃肠外科学组组长，上海复旦大学附属中山医院副院长，外科主任。副主编王衫教授，现任中华医学会外科学分会胃肠外科学组副组长，北京大学人民医院院长，胃肠外科主任，外科肿瘤研究室主任。副主编朱正纲教授，现任中华医学会外科学分会胃肠外科学组委员，上海交通大学副校长，上海交通大学医学院院长，瑞金医院外科主任。副主编李世拥主任，现任中华医学会外科学分会胃肠外科学组副组长，北京军区总医院胃肠外科主任。副主编顾晋教授，现任中华医学会外科学分会结直肠肛门外科学组副组长，北京大学临床肿瘤学院副院长。副主编兰平教授，现任中山大学附属第六医院（附属胃肠肛门医院）副院长。林锋主任，现任中华医学会外科学分会营养支持学组副组长，广东省胃肠外科学组副组长，广东省人民医院胃肠外科主任。

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